MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 24239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018622	GTT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018622	AGA	3	9	75	83	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018622	TA	3	6	93	98	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018622	CGA	2	6	170	175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457549
5	NC_018622	AGA	2	6	188	193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457549
6	NC_018622	CTT	2	6	225	230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457549
7	NC_018622	T	7	7	256	262	0 %	100 %	0 %	0 %	407457549
8	NC_018622	AAGG	2	8	266	273	50 %	0 %	50 %	0 %	407457549
9	NC_018622	A	6	6	274	279	100 %	0 %	0 %	0 %	407457549
10	NC_018622	GT	3	6	309	314	0 %	50 %	50 %	0 %	407457549
11	NC_018622	TCT	2	6	331	336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457549
12	NC_018622	A	7	7	478	484	100 %	0 %	0 %	0 %	407457549
13	NC_018622	TG	3	6	498	503	0 %	50 %	50 %	0 %	407457549
14	NC_018622	TAT	2	6	553	558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457549
15	NC_018622	ATG	2	6	579	584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457549
16	NC_018622	GCGT	2	8	588	595	0 %	25 %	50 %	25 %	407457549
17	NC_018622	TGT	2	6	640	645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457549
18	NC_018622	ATG	2	6	659	664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457549
19	NC_018622	TC	3	6	727	732	0 %	50 %	0 %	50 %	407457549
20	NC_018622	ACA	2	6	950	955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457549
21	NC_018622	AGC	2	6	964	969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457549
22	NC_018622	GTG	2	6	981	986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457549
23	NC_018622	AGC	3	9	1000	1008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457549
24	NC_018622	CTA	2	6	1011	1016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457549
25	NC_018622	GGT	2	6	1020	1025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457549
26	NC_018622	CTT	2	6	1128	1133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457549
27	NC_018622	TTC	2	6	1146	1151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018622	GAA	2	6	1152	1157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018622	CTT	2	6	1225	1230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457550
30	NC_018622	AC	3	6	1295	1300	50 %	0 %	0 %	50 %	407457550
31	NC_018622	TTAA	2	8	1353	1360	50 %	50 %	0 %	0 %	407457550
32	NC_018622	ACA	2	6	1365	1370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457550
33	NC_018622	ATG	2	6	1413	1418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457550
34	NC_018622	GT	3	6	1461	1466	0 %	50 %	50 %	0 %	407457550
35	NC_018622	TTA	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457550
36	NC_018622	TAG	2	6	1576	1581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457550
37	NC_018622	TC	3	6	1584	1589	0 %	50 %	0 %	50 %	407457550
38	NC_018622	TAG	2	6	1714	1719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457550
39	NC_018622	CTA	2	6	1768	1773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457550
40	NC_018622	TTC	2	6	1789	1794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457550
41	NC_018622	TG	3	6	1888	1893	0 %	50 %	50 %	0 %	407457550
42	NC_018622	ATA	2	6	1989	1994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457550
43	NC_018622	CTT	2	6	2056	2061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457550
44	NC_018622	GAA	2	6	2067	2072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457550
45	NC_018622	TGA	2	6	2128	2133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457550
46	NC_018622	GAT	2	6	2146	2151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457550
47	NC_018622	GTT	2	6	2182	2187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457550
48	NC_018622	CTT	2	6	2206	2211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457550
49	NC_018622	T	6	6	2210	2215	0 %	100 %	0 %	0 %	407457550
50	NC_018622	T	8	8	2289	2296	0 %	100 %	0 %	0 %	407457550
51	NC_018622	TAA	2	6	2368	2373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457550
52	NC_018622	GAA	2	6	2415	2420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457550
53	NC_018622	AGAT	2	8	2543	2550	50 %	25 %	25 %	0 %	407457550
54	NC_018622	T	7	7	2617	2623	0 %	100 %	0 %	0 %	407457551
55	NC_018622	T	8	8	2628	2635	0 %	100 %	0 %	0 %	407457551
56	NC_018622	AGT	2	6	2642	2647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457551
57	NC_018622	TTA	2	6	2655	2660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457551
58	NC_018622	TCC	2	6	2684	2689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457551
59	NC_018622	T	6	6	2729	2734	0 %	100 %	0 %	0 %	407457551
60	NC_018622	TTC	2	6	2777	2782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457551
61	NC_018622	GA	3	6	2785	2790	50 %	0 %	50 %	0 %	407457551
62	NC_018622	TTA	2	6	2802	2807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457551
63	NC_018622	TGTT	2	8	2840	2847	0 %	75 %	25 %	0 %	407457551
64	NC_018622	T	6	6	2884	2889	0 %	100 %	0 %	0 %	407457551
65	NC_018622	T	6	6	2896	2901	0 %	100 %	0 %	0 %	407457551
66	NC_018622	AGA	2	6	2933	2938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457551
67	NC_018622	GAAG	2	8	2951	2958	50 %	0 %	50 %	0 %	407457551
68	NC_018622	TAT	2	6	2971	2976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457551
69	NC_018622	TAT	2	6	3005	3010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457551
70	NC_018622	T	6	6	3010	3015	0 %	100 %	0 %	0 %	407457551
71	NC_018622	TAT	2	6	3057	3062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018622	ATT	3	9	3072	3080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018622	TGT	2	6	3085	3090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018622	T	6	6	3101	3106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018622	GAA	2	6	3216	3221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457552
76	NC_018622	TTTG	2	8	3299	3306	0 %	75 %	25 %	0 %	407457552
77	NC_018622	TCCT	2	8	3325	3332	0 %	50 %	0 %	50 %	407457552
78	NC_018622	GA	3	6	3339	3344	50 %	0 %	50 %	0 %	407457552
79	NC_018622	GAAAA	2	10	3355	3364	80 %	0 %	20 %	0 %	407457552
80	NC_018622	ATG	2	6	3421	3426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457552
81	NC_018622	TGGT	2	8	3490	3497	0 %	50 %	50 %	0 %	407457552
82	NC_018622	CTT	2	6	3542	3547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457552
83	NC_018622	CAA	2	6	3627	3632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457552
84	NC_018622	ATC	2	6	3778	3783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457552
85	NC_018622	TGG	2	6	3891	3896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457552
86	NC_018622	AAG	2	6	3918	3923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457552
87	NC_018622	AGA	2	6	4142	4147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457552
88	NC_018622	T	6	6	4190	4195	0 %	100 %	0 %	0 %	407457552
89	NC_018622	TAA	2	6	4208	4213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457552
90	NC_018622	AT	3	6	4226	4231	50 %	50 %	0 %	0 %	407457552
91	NC_018622	GAA	2	6	4245	4250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457552
92	NC_018622	AGC	2	6	4283	4288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457552
93	NC_018622	TAA	2	6	4312	4317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457552
94	NC_018622	AGGAG	2	10	4412	4421	40 %	0 %	60 %	0 %	407457552
95	NC_018622	AGA	2	6	4432	4437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457552
96	NC_018622	CTT	2	6	4449	4454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457552
97	NC_018622	ATG	2	6	4473	4478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457552
98	NC_018622	GAT	2	6	4524	4529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457552
99	NC_018622	GCT	2	6	4578	4583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457552
100	NC_018622	CT	3	6	4728	4733	0 %	50 %	0 %	50 %	407457552
101	NC_018622	GAA	2	6	4808	4813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457552
102	NC_018622	CTGTGG	2	12	4819	4830	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	407457552
103	NC_018622	AAG	2	6	4831	4836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457552
104	NC_018622	TGG	2	6	4909	4914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457552
105	NC_018622	AAG	2	6	5008	5013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457552
106	NC_018622	AGA	2	6	5111	5116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457552
107	NC_018622	TTA	2	6	5131	5136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457552
108	NC_018622	CAA	2	6	5219	5224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457552
109	NC_018622	GAAA	2	8	5254	5261	75 %	0 %	25 %	0 %	407457552
110	NC_018622	CAA	2	6	5337	5342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018622	TTG	2	6	5348	5353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018622	AATC	2	8	5413	5420	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_018622	T	7	7	5456	5462	0 %	100 %	0 %	0 %	407457553
114	NC_018622	AGA	2	6	5519	5524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457553
115	NC_018622	CGAG	2	8	5525	5532	25 %	0 %	50 %	25 %	407457553
116	NC_018622	TGG	2	6	5585	5590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457553
117	NC_018622	TAT	2	6	5620	5625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457553
118	NC_018622	GTT	2	6	5666	5671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457553
119	NC_018622	CAA	2	6	5682	5687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457553
120	NC_018622	GAT	2	6	5709	5714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457553
121	NC_018622	TGT	2	6	5729	5734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457553
122	NC_018622	GGA	2	6	5751	5756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457553
123	NC_018622	T	6	6	5785	5790	0 %	100 %	0 %	0 %	407457553
124	NC_018622	CAA	2	6	5862	5867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457553
125	NC_018622	TGA	2	6	5924	5929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457553
126	NC_018622	GAT	2	6	5930	5935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457553
127	NC_018622	TGT	3	9	5982	5990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457553
128	NC_018622	TGA	2	6	6046	6051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457553
129	NC_018622	GCT	2	6	6062	6067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457553
130	NC_018622	T	7	7	6071	6077	0 %	100 %	0 %	0 %	407457553
131	NC_018622	AC	3	6	6152	6157	50 %	0 %	0 %	50 %	407457553
132	NC_018622	TGC	2	6	6221	6226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457553
133	NC_018622	TGA	2	6	6242	6247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457553
134	NC_018622	GAA	2	6	6273	6278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457553
135	NC_018622	A	6	6	6277	6282	100 %	0 %	0 %	0 %	407457553
136	NC_018622	GAG	2	6	6286	6291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457553
137	NC_018622	TTC	2	6	6296	6301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457553
138	NC_018622	CCT	2	6	6303	6308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457553
139	NC_018622	CTT	2	6	6349	6354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457553
140	NC_018622	GTT	2	6	6391	6396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457553
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142	NC_018622	T	6	6	6483	6488	0 %	100 %	0 %	0 %	407457553
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259	NC_018622	T	7	7	11821	11827	0 %	100 %	0 %	0 %	407457558
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261	NC_018622	AAG	3	9	11897	11905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457558
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267	NC_018622	TAAT	2	8	12146	12153	50 %	50 %	0 %	0 %	407457558
268	NC_018622	AGA	2	6	12184	12189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457558
269	NC_018622	TAG	2	6	12216	12221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457558
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271	NC_018622	TTC	3	9	12280	12288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457558
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279	NC_018622	GA	3	6	12584	12589	50 %	0 %	50 %	0 %	407457558
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394	NC_018622	ATA	2	6	18392	18397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457562
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397	NC_018622	TCC	2	6	18547	18552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
398	NC_018622	TAA	2	6	18574	18579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457563
399	NC_018622	A	6	6	18681	18686	100 %	0 %	0 %	0 %	407457563
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401	NC_018622	GGA	2	6	18861	18866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457564
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403	NC_018622	ATTA	2	8	18989	18996	50 %	50 %	0 %	0 %	407457564
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